研究论文/Research Article

EcoTILLING高通量分析甘蓝型油菜种质叶绿体rps16基因的多态性  

蔡梦鲜1,2 , 乔江伟1 , 闫贵欣1 , 吴金锋1 , 李再云2 , 伍晓明1
1 中国农业科学院油料作物研究所, 农业部油料作物生物学重点开放实验室, 武汉, 430062;
2 华中农业大学植物科学技术学院, 武汉, 430070
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2014 年, 第 12 卷, 第 2 篇   doi: 10.13271/j.mpb.012.001067
收稿日期: 2014年03月18日    接受日期: 2014年05月12日    发表日期: 2014年06月16日
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推荐引用:

Cai M.X., Qiao J.W., Yan G.X., Wu J.F., Li Z.Y., and Wu X.M., 2014, High-throughput Discovery of Chloroplast rps16 Gene Polymorphisms in Collections of Brasssica napus L. by EcoTILLING, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 12(6): 1067-1076 (蔡梦鲜, 乔江伟, 闫贵欣, 吴金锋, 李再云, 伍晓明, 2014, EcoTILLING高通量分析甘蓝型油菜种质叶绿体rps16基因的多态性, 分子植物育种, 12(6): 1067-1076)

摘要

叶绿体rps16基因作为叶绿体重要基因,广泛应用于植物系统发育研究,而甘蓝型油菜rps16基因多态性研究尚未见报道。本研究利用二维EcoTILLING (ecotype targeting induced local lesions in genomes)技术及Sanger测序技术对全球256份甘蓝型油菜种质资源的rps16基因进行多态性分析。结果发现,256份甘蓝型油菜rps16基因有5个多态性位点,经测序检测其存在4种单倍型;5个SNP位点都位于非编码序列上。研究结果表明,rps16基因在不同材料中具有丰富的遗传变异,可为其它基因遗传多样性研究提供借鉴,有助于对油菜种质资源进行评估和多样性分类。

关键词
甘蓝型油菜;rps16基因;SNP;EcoTILLING

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《分子植物育种》印刷版
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